https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/ Recent content on Neuro-Kolloquium Hugo -- gohugo.io martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) Tue, 23 Jun 2026 00:00:00 +0000 https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/upcoming/ Tue, 23 Jun 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/upcoming/ Das nächste Treffen ist am Donnerstag 2.7.2026, 16:15 in S1-115. Wir freuen uns auf Eure Teilnahme! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-06-11-27th/ Thu, 11 Jun 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-06-11-27th/ Im siebenundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://fmriprep.org/en/1.1.4/outputs.html Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-05-07-26th/ Thu, 07 May 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-05-07-26th/ Im sechsundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://fmriprep.org/en/1.1.4/outputs.html Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-03-05-25th/ Thu, 05 Mar 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-03-05-25th/ Im fünfundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-02-06-24th/ Thu, 05 Feb 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-02-06-24th/ Im vierundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://www.psychopy.org/ Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-01-08-23rd/ Thu, 08 Jan 2026 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2026-01-08-23rd/ Im dreiundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: BIDS-Format: https://bids.neuroimaging.io/ BIDS-Validator: https://bids-standard.github.io/bids-validator/ Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-12-04-22nd/ Thu, 04 Dec 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-12-04-22nd/ Im zweiundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: fieldmaps und A-P P-A: https://doi.org/10.3389/fnins.2021.642808 Visualisierung und Tabellen: https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2007.11.048 , https://github.com/miykael/atlasreader Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-11-06-21st/ Thu, 27 Nov 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-11-06-21st/ Im einundzwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://nilearn.github.io/stable/glm/first_level_model.html https://nilearn.github.io/stable/glossary.html#term-functional-connectivity Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-09-02-20th/ Tue, 02 Sep 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-09-02-20th/ Im zwanzigsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://www.nitrc.org/projects/mricrogl/ Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-08-08-19th/ Thu, 07 Aug 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-08-08-19th/ Im neunzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://fmriprep.org/en/stable/ Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-06-25-18th/ Thu, 05 Jun 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-06-25-18th/ Im achtzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://citeseerx.ist.psu.edu/document?repid=rep1&type=pdf&doi=c091e216d21e54f825b90d9ab5a452fcd41b42e4 https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/~john/misc/VBMclass15.pdf Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-05-27-17th/ Thu, 08 May 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-05-27-17th/ Im siebzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://alliance.seas.upenn.edu/~cis520/dynamic/2022/wiki/uploads/Lectures/PCA_ICA.png https://nilearn.github.io/stable/auto_examples/03_connectivity/plot_compare_decomposition.html Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-03-06-16th/ Thu, 06 Mar 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-03-06-16th/ Im sechzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: https://gate.nmr.mgh.harvard.edu/wiki/whynhow/images/2/20/HensonPenny_ANOVA_03.pdf https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/~wpenny/publications/spm-book/anova.pdf https://marsbar-toolbox.github.io/index.html https://rfxplot.sourceforge.net/ https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/course/video/ Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-02-07-15th/ Fri, 07 Feb 2025 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2025-02-07-15th/ Im fünfzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: CONN-Toolbox https://web.conn-toolbox.org/ Default Mode Network Shulman, G. L., Fiez, J. A., Corbetta, M., Buckner, R. L., Miezin, F. M., Raichle, M. E., & Petersen, S. E. (1997). Common blood flow changes across visual tasks: II. Decreases in cerebral cortex. Journal of cognitive neuroscience, 9(5), 648-663. https://citeseerx.ist.psu.edu/document?repid=rep1&type=pdf&doi=08e52bcab4c64c6b87803ccbee7dac09a7515e8e Yeo, B. T., Krienen, F. M., Sepulcre, J., Sabuncu, M. R., Lashkari, D., Hollinshead, M., … & Buckner, R. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-12-05-14th/ Thu, 05 Dec 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-12-05-14th/ Im vierzehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie können wir Artefakte in T1 und T2*-Bildern erkennen? Verwendete Datensätze waren https://openneuro.org/datasets/ds004173/versions/1.0.2 https://openneuro.org/datasets/ds001419/versions/1.0.1 Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-11-07-13th/ Thu, 07 Nov 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-11-07-13th/ Im dreizehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie gehen wir mit Kovariaten um? Miller, G. A., & Chapman, J. P. (2001). Misunderstanding analysis of covariance. Journal of abnormal psychology, 110(1), 40. https://osf.io/j27f5/download Wie können wir ein 2nd level Design in nilearn rechnen (Notebook) Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-10-16-twelfth/ Thu, 10 Oct 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-10-16-twelfth/ Im zwöften Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Was sind beta-dateien und con-datein in SPM? Wie werden Sie für Gruppenanlysen genutzt Wie sieht ein einfaches Second-Level-Design aus? (fil.ion.ucl.ac.uk/spm/data/face_rfx/) Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-08-01-eleventh/ Thu, 01 Aug 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-08-01-eleventh/ Im elften Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie können wir aus einer Psychopy .log Datei eine Matlab .m Datei für SPM machen? (Python-Skript) Wie können wir in SPM ein Design ohne Daten ausprobieren? (SPM First Level Design) Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-07-04-tenth/ Thu, 04 Jul 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-07-04-tenth/ Im zehnten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie sieht eine SPM Onset Datei aus (für First Level -> Multiple Conditions)? (Vorlage) Wie können wir aus einer Psychopy .log Datei eine Matlab .m Datei für SPM machen? (Python-Skript) Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-06-06-ninth/ Thu, 06 Jun 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-06-06-ninth/ Im neunten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Arbeit mit der “Results”-Funktion von SPM (Handout) neurosynth.org um MNI-Koordinaten zu interpretieren Atlanten: AAL, WFU Pickatlas, Anatomy Toolbox (Jülich) Visualisierung mit SPM: xjView, rfxplot (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ext/) Alternativen zu SPM: MricroGL, FSLeyes Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-05-02-eighth/ Thu, 02 May 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-05-02-eighth/ Im achten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Arbeit mit Matlab (und Octave als mögliche Alternative: https://octave.org/ ) SPM Standalone für Arbeiten ohne Matlab: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/docs/installation/standalone/ Toolboxen für SPM: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ext/ CONN Toolbox: https://web.conn-toolbox.org/ Erste Schritte (Handout) Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-04-07-seventh/ Sun, 07 Apr 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-04-07-seventh/ Im siebenten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Bewegungsartefakte, Signalveränderungen durch Bewegung Präprozessierung (Realignment, Coregistration, Normalization) Bewegung des Gehirns durch Atmung und Herzschlag Unterschiede in strukturellen und funktionellen Bilder in Bezug auf Artefakte Auslöschungen an Luft-Gewebe-Grenzen Trade-off zwischen Signal- und Artefaktstärke Animationsansicht und Overlays in MricroGL nutzen Folgende Artikel und Links könnten interessant sein: Spatial Preprocessing - Ged Ridgway http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/course/slides11/02_Preprocessing_FIL2011May.pptx Terem et al. 2018 - Revealing sub-voxel motions of brain tissue using phase-based amplified MRI (aMRI) https://doi. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-03-07-sixth/ Thu, 07 Mar 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-03-07-sixth/ Im sechsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Regressoren für verschiedene Bedingungen und ihre Gewichtungen (“betas”) Bedeutung der Konstante für die Modellgüte Bilden von Kontrasten in SPM Inhaltliche Konzeption von Kontrasten (enge Kontrollbedingung vs. unspezifische Baseline) Folgende Artikel könnten interessant sein: Grill-Spector, K., & Weiner, K. S. (2014). The functional architecture of the ventral temporal cortex and its role in categorization. Nature Reviews Neuroscience, 15(8), 536-548. https://doi.org/10.1038/nrn3747 Stark, C. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-02-04-fifth/ Thu, 01 Feb 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-02-04-fifth/ Im fünften Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Volumen, Runs und Sessions Interstimulusintervalle und Jitter Dummy-Scans, Verzögerungen der HRF Folgende Software könnte interessant sein: https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/optseq/ https://web.archive.org/web/20160413081427/https://www.mccauslandcenter.sc.edu/crnl/tools/fmristim Sowie folgende Webseite: https://imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/imaging/DesignEfficiency Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-01-11-fourth/ Thu, 11 Jan 2024 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2024-01-11-fourth/ Im vierten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Geblockte Designs Blocklänge vs. Blockanzahl Reihenfolgeeffekte Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-12-11-third/ Sun, 10 Dec 2023 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-12-11-third/ Im dritten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie prozessiere ich resting-state fMRT-Daten? Drifts Signal in weißer Substanz und CSF Denoising PCA Bewegungsparameter und frame-wise displacement High-Pass und Low-Pass Filter AROMA-ICA Relevante Artikel: A method for using blocked and event-related fMRI data to study “resting state” functional connectivity https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2006.11.051 Task-free MRI predicts individual differences in brain activity during task performance https://doi.org/10.1126/science.aad8127 Reconfigurable task-dependent functional coupling modes cluster around a core functional architecture https://royalsocietypublishing. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-11-02-second/ Thu, 02 Nov 2023 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-11-02-second/ Im zweiten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie erstelle ich ein event-related Experiment? Länge der Abstände zwischen Trials Variabilität von Jittern Abtasten der HRF durch Onsets die nicht durch die TR teilbar sind Parametrische Designs oder nur Extreme Abstufungen? Wie mit Motorikartefakten beim Drücken von Tasten umgehen? evtl. relevant: https://doi.org/10.1371%2Fjournal.pone.0126255 Danke an alle, die teilgenommen haben! https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-10-06-first/ Fri, 06 Oct 2023 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/posts/2023-10-06-first/ Im ersten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Was ist beim Design von fMRT-Paradigmen zu beachten? Es gibt Scanner interene Dummy Scans und ggf. Experiment interne Dummy Scans In der Regel triggern wir nur den einzelnen Run, einzelne Volumen bzw. einzelne Elemente aus dem Paradigma zu triggern scheint in der Regel nicht notwendig, da die zeitliche Auflösung ohnehin nicht so gut ist, zudem hat man einen räumlichen Vorteile wenn nicht jede Schicht zum gleichen Zeitpunkt gemessen wurde und die zeitliche Auflösung der HRF Kurve deutlich höher (dies wäre aber auch mit einem Interstimulusintervall trotz einzelner Trigger für einzelne Elemente des Paradigmas umsetzbar) Sollten alle Probanden die identischen Stimuli im fMRT sehen? https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/about/2023-08-07-about/ Mon, 07 Aug 2023 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/about/2023-08-07-about/ Zielgruppe: Studierende Promovierende Post-Docs Schwerpunkte: strukturelles MRT: Volumetrischen Analysen (SPM12, CAT12) Analyse von Fasertrakten (DTI) Analysen der Kortexoberfläche (FreeSurfer) Trakt-Basierter Statistik (TBSS, Tracula) funktionelles MRT: Aufgabenbezogene Fragestellungen (task fMRI) Netzwerkbezogene Fragestellungen (resting-state fMRI) Analysen mit Matlab/SPM12, mit Freesurfer oder mit Python/NiLearn Visualisierung von Bildgebungsdaten (Mircron, MricroGL, FreeView, Papaya) Anatomische und funktionelle Interpretation (Arbeit mit Hirnatlanten wie dem Harvard-Oxford Atlas und Online-Metaanalysen wie NeuroSynth. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-blogs/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-blogs/ Hier sammeln wir ein Liste von Blogs, in denen fMRT-Forschung und Datenanalyse diskutiert werden Towards Data Science | https://towardsdatascience.com The Neurocritic | https://neurocritic.blogspot.com BishopBlog | https://deevybee.blogspot.com Mumford Brain Stats | https://mumfordbrainstats.tumblr.com/ https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-11-06-forums/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-11-06-forums/ Hier sammeln wir ein Liste von Foren, in denen fMRT-Forschung und Datenanalyse diskutiert werden Neurostars | https://neurostars.org/ SPM Mailing List | https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/webadmin?A0=SPM freesurfer Mailing List | https://www.mail-archive.com/freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu/ https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2024-02-15-fortbildungen/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2024-02-15-fortbildungen/ Fortbildungen, Workshops, etc. Epileptologisches Kolloquium Mara (Mo, 16:30): https://www.mara.de/universitaetsklinik-fuer-epileptologie/fortbildung/epileptologisches-und-neurowissenschaftliches-kolloquium Neurozentrum Bethel (Do, 17:00): https://www.mara.de/universitaetsklinik-fuer-epileptologie/fortbildung/neurozentrum-bethel ILAE Neuroimaging School: https://www.ilae.org/congresses Neurohackademy: https://neurohackademy.org/ Neuromatch: https://academy.neuromatch.io/ Student Network for Neuroscience: https://proud-blossom-08d.notion.site/Student-Network-for-Neuroscience-1f245cc861518018bedede30814a466f#1f345cc8615180eda0f4e53b30ea8f84 https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-pods/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-pods/ Hier sammeln wir ein Liste von Podcasts, in denen fMRT Forschung und Datenanalyse diskutiert werden Brain Inspired | https://braininspired.co/podcast The Language Neuroscience Podcast | https://langneurosci.org/podcast Talk Python to Me | https://talkpython.fm/episodes/all https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-10-14-software/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-10-14-software/ Hier sammeln wir ein Liste von Software und Online-Tools, die für fMRT-Forschung und Datenanalyse relevant sind: Software für Präprozessierung und Auswertung: SPM12: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/ FSL: https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/ FreeSurfer: https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ AFNI: https://afni.nimh.nih.gov/ Nipype: https://nipype.readthedocs.io/en/latest/index.html Erstellung von Paradigmen: Psychopy: https://www.psychopy.org/ Präprozessierung: fMRIprep: https://fmriprep.org/en/stable/ fMRT-Analyse: NiLearn: https://nilearn.github.io/stable/index.html CONN: https://web.conn-toolbox.org/ DTI/Traktographie: Tracula: https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/Tracula TBSS: https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/TBSS/UserGuide VBM/Volumetrie: CAT12: http://www.neuro.uni-jena.de/cat/ Daten: NeuroVault: https://neurovault.org/ OpenNeuro: https://openneuro.org/ Meta-Analysen und Atlanten: https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2024-03-08-sose24/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2024-03-08-sose24/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Thema Uhrzeit Ort Do. 4.04.2024 Visuelle Inspektion von Daten 16:15-17:45 X-E0-203 Do. 2.05.2024 Einführung in SPM 16:15-17:45 X-E0-203 Do. 6.06.2024 SPM (Fortsetzung) 16:15-17:45 X-E0-203 Do. 4.07.2024 First Level Designs 16:15-17:45 X-E0-203 Do. 1.08.2024 First Level Designs (Fortsetzung) 16:15-17:45 X-E0-203 Wo? https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2025-03-21-sose25/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2025-03-21-sose25/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Thema Uhrzeit Ort Do. 8.05.2025 ICA 16:15-17:45 S0-115 Do. 5.06.2025 VBM 16:15-17:45 S0-115 Do. 7.08.2025 Dateninspektion 16:15-17:45 S0-115 Wo? Vor Ort https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2026-03-19-sose26/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2026-03-19-sose26/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Thema Uhrzeit Ort Do. 7.5.2026 Präprozessierung 16:15-17:45 Mara Do. 11.6.2026 fMRIprep 16:15-17:45 Mara Do. 2.7.2026 TBA 16:15-17:45 S0-115 Do. 6.8.2026 TBA 16:15-17:45 TBA Do. 3.9.2026 TBA 16:15-17:45 TBA Wo? Vor Ort (Raum siehe Terminbeschreibung) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-lehrmaterial/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/resources/2023-08-07-lehrmaterial/ Zum Einstieg Vorlesung Kognitive Neuro Tutorials und Bücher: Wie können wir Gedanken lesen? https://ldeitermann.pages.ub.uni-bielefeld.de/fmrt-explained/intro.html Neuroimaging Data Science https://neuroimaging-data-science.org/root.html Neurohackademy https://neurohackademy.org/ Aperture Neuro https://apertureneuro.org/ Handbook of fMRI data analysis (Poldrack, Mumford, Nichols): https://katalogplus.ub.uni-bielefeld.de/Record/991025810618306442 VBM Tutorial, Ashburner: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/~john/misc/VBMclass15.pdf SPM Course 2011: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/course/video/ https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2023-08-07-wise2324/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2023-08-07-wise2324/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Uhrzeit Ort Do. 5.10.2023 16:15-17:45 T2-234 Do. 2.11.2023 16:15-17:45 T2-234 Do. 7.12.2023 16:15-17:45 T2-234 Do. 11.01.2024 16:15-17:45 T2-234 Do. 1.02.2024 16:15-17:45 T2-234 Do. 7.03.2024 16:15-17:45 T2-214 Wo? Vor Ort, TBA https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2024-08-02-wise2425/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2024-08-02-wise2425/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Thema Uhrzeit Ort Do. 10.10.2024 Second Level Designs 16:15-17:45 C01-246 Do. 7.11.2024 Second Level Designs 16:15-17:45 C01-246 Do. 5.12.2024 Visuelle Dateninspektion 16:15-17:45 X-E0-203 Do. 6.02.2025 Konnektivität 16:15-17:45 U2-232 Do. 6.03.2025 ANOVAs 16:15-17:45 U2-232 Wo? Vor Ort, s.o. https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2025-10-02-wise2526/ Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000 martin.wegrzyn@uni-bielefeld.de (Neuro-Kolloquium Bielefeld) https://neuro.pages.ub.uni-bielefeld.de/neuro/termine/2025-10-02-wise2526/ Treffen ist in der Regel am ersten Donnerstag im Monat 16:15-17:45 Termine: Datum Thema Uhrzeit Ort Do. 6.11.2025 nilearn und PPI 16:15-17:45 S0-119 Do. 4.12.2025 fieldmaps und Visualisierung 16:15-17:45 S0-119 Do. 8.01.2026 BIDS Format 16:15-17:45 S0-119 Do. 5.02.2026 psychopy 16:15-17:45 S0-119 Do. 5.03.2026 TBA 16:15-17:45 U2-228 Wo? Vor Ort (Raum siehe Terminbeschreibung)