Software

Hier sammeln wir ein Liste von Software und Online-Tools, die für fMRT-Forschung und Datenanalyse relevant sind:

Software für Präprozessierung und Auswertung:

• SPM12: https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/
• FSL: https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/
• FreeSurfer: https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/
• AFNI: https://afni.nimh.nih.gov/
• Nipype: https://nipype.readthedocs.io/en/latest/index.html

Erstellung von Paradigmen:

• Psychopy: https://www.psychopy.org/

Präprozessierung:

• fMRIprep: https://fmriprep.org/en/stable/

fMRT-Analyse:

• NiLearn: https://nilearn.github.io/stable/index.html
• CONN: https://web.conn-toolbox.org/

DTI/Traktographie:

• Tracula: https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/Tracula
• TBSS: https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/TBSS/UserGuide

VBM/Volumetrie:

• CAT12: http://www.neuro.uni-jena.de/cat/

Daten:

• NeuroVault: https://neurovault.org/
• OpenNeuro: https://openneuro.org/

Meta-Analysen und Atlanten:

• NeuroSynth: http://www.neurosynth.org/
• Hirnatlanten: https://scalablebrainatlas.incf.org/

Datenorganisation:

• BIDS: https://bids.neuroimaging.io
• DataLad: https://www.datalad.org/