7. Treffen

16:15 vor Ort

Im siebenten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Bewegungsartefakte, Signalveränderungen durch Bewegung Präprozessierung (Realignment, Coregistration, Normalization) Bewegung des Gehirns durch Atmung und Herzschlag Unterschiede in strukturellen und funktionellen Bilder in Bezug auf Artefakte Auslöschungen an Luft-Gewebe-Grenzen Trade-off zwischen Signal- und Artefaktstärke Animationsansicht und Overlays in MricroGL nutzen Folgende Artikel und Links könnten interessant sein: Spatial Preprocessing - Ged Ridgway http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/course/slides11/02_Preprocessing_FIL2011May.pptx Terem et al. 2018 - Revealing sub-voxel motions of brain tissue using phase-based amplified MRI (aMRI) https://doi. [Read More]
#termine 

6. Treffen

16:15 vor Ort

Im sechsten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Regressoren für verschiedene Bedingungen und ihre Gewichtungen (“betas”) Bedeutung der Konstante für die Modellgüte Bilden von Kontrasten in SPM Inhaltliche Konzeption von Kontrasten (enge Kontrollbedingung vs. unspezifische Baseline) Folgende Artikel könnten interessant sein: Grill-Spector, K., & Weiner, K. S. (2014). The functional architecture of the ventral temporal cortex and its role in categorization. Nature Reviews Neuroscience, 15(8), 536-548. https://doi.org/10.1038/nrn3747 Stark, C. [Read More]
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4. Treffen

16:15 vor Ort

Im vierten Treffen wurden folgende Themen diskutiert:

  • Geblockte Designs
  • Blocklänge vs. Blockanzahl
  • Reihenfolgeeffekte

Danke an alle, die teilgenommen haben!

#termine 

3. Treffen

16:15 vor Ort

Im dritten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Wie prozessiere ich resting-state fMRT-Daten? Drifts Signal in weißer Substanz und CSF Denoising PCA Bewegungsparameter und frame-wise displacement High-Pass und Low-Pass Filter AROMA-ICA Relevante Artikel: A method for using blocked and event-related fMRI data to study “resting state” functional connectivity https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2006.11.051 Task-free MRI predicts individual differences in brain activity during task performance https://doi.org/10.1126/science.aad8127 Reconfigurable task-dependent functional coupling modes cluster around a core functional architecture https://royalsocietypublishing. [Read More]
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2. Treffen

16:15 vor Ort

Im zweiten Treffen wurden folgende Themen diskutiert:

Wie erstelle ich ein event-related Experiment?

  • Länge der Abstände zwischen Trials
  • Variabilität von Jittern
  • Abtasten der HRF durch Onsets die nicht durch die TR teilbar sind
  • Parametrische Designs oder nur Extreme Abstufungen?
  • Wie mit Motorikartefakten beim Drücken von Tasten umgehen?
  • evtl. relevant: https://doi.org/10.1371%2Fjournal.pone.0126255

Danke an alle, die teilgenommen haben!

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1. Treffen

16:15 vor Ort

Im ersten Treffen wurden folgende Themen diskutiert: Was ist beim Design von fMRT-Paradigmen zu beachten? Es gibt Scanner interene Dummy Scans und ggf. Experiment interne Dummy Scans In der Regel triggern wir nur den einzelnen Run, einzelne Volumen bzw. einzelne Elemente aus dem Paradigma zu triggern scheint in der Regel nicht notwendig, da die zeitliche Auflösung ohnehin nicht so gut ist, zudem hat man einen räumlichen Vorteile wenn nicht jede Schicht zum gleichen Zeitpunkt gemessen wurde und die zeitliche Auflösung der HRF Kurve deutlich höher (dies wäre aber auch mit einem Interstimulusintervall trotz einzelner Trigger für einzelne Elemente des Paradigmas umsetzbar) Sollten alle Probanden die identischen Stimuli im fMRT sehen? [Read More]
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